Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp4P35123 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp4P35123 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp4P35123 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp4P35123 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Usp4P35123 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp4P35123 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms