Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nedd1P33215 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nedd1P33215 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Nedd1P33215 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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