Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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