Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NapbP28663 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NapbP28663 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NapbP28663 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NapbP28663 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NapbP28663 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NapbP28663 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NapbP28663 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NapbP28663 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NapbP28663 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NapbP28663 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NapbP28663 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NapbP28663 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms