Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6aP27664 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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