Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PdgfraP26618 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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