Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrkchP23298 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrkchP23298 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms