Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PrkcaP20444 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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