Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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OtcP11725 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
OtcP11725 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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OtcP11725 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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