Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxd4P10628 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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