Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Pfdn4-202ENSMUST00000075087 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Zfp169-201ENSMUST00000110110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Sh3bgrl2-204ENSMUST00000188241 3155 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Tro-207ENSMUST00000163969 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Asic2-202ENSMUST00000066197 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Slc30a2-202ENSMUST00000105872 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Prm2P07978 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms