Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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H2-Eb1P04230 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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H2-Eb1P04230 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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H2-Eb1P04230 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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H2-Eb1P04230 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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H2-Eb1P04230 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-Eb1P04230 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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