Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tgfb1P04202 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Tgfb1P04202 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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