Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vamp4O70480 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vamp4O70480 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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