Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zmat3O54836 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms