Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrxO54751 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrxO54751 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CrxO54751 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrxO54751 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrxO54751 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrxO54751 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrxO54751 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrxO54751 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrxO54751 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrxO54751 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms