Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Tmem156-201ENSMUST00000043352 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
ColqO35348 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms