Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Pkd2O35245 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Pkd2O35245 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Pkd2O35245 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Pkd2O35245 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Pkd2O35245 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Pkd2O35245 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Pkd2O35245 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Pkd2O35245 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Pkd2O35245 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Pkd2O35245 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkd2O35245 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms