Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Kcns1O35173 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Kcns1O35173 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Kcns1O35173 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Kcns1O35173 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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