Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Casq1O09165 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Casq1O09165 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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