Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr770-201ENSMUST00000062314 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm20682-201ENSMUST00000176552 3517 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms