Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5225J3QPL3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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