Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm2035J3QP87 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm2035J3QP87 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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