Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms