Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm20828J3KMI7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20828J3KMI7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms