Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Taf4bG5E8Z2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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