Protein–RNA interactions for Protein: F8VQH7

Dbx2, Developing brain homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx2F8VQH7 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Dbx2F8VQH7 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Dbx2F8VQH7 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms