Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms