Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms