Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Zfp988F6VKC7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Zfp988F6VKC7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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Zfp988F6VKC7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Zfp988F6VKC7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Zfp988F6VKC7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Zfp988F6VKC7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Zfp988F6VKC7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Zfp988F6VKC7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Zfp988F6VKC7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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