Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm5478D3Z6R0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm5478D3Z6R0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5478D3Z6R0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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