Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms