Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rd3lB2RV38 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rd3lB2RV38 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rd3lB2RV38 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rd3lB2RV38 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Rd3lB2RV38 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rd3lB2RV38 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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