Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rrn3B2RS91 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms