Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spocd1B1ASB6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms