Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PtprsB0V2N1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms