Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms