Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ambra1A2AH22 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms