Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ckap5A2AGT5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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