Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm16A2A935 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Prdm16A2A935 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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