Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms