Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms