Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdac6Q9Z2V5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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