Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubl3Q9Z2M6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms