Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Psma1Q9R1P4 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms