Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr54Q9R0D8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.3 ms