Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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