Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms