Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Snap29Q9ERB0 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Snap29Q9ERB0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Snap29Q9ERB0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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