Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clstn2Q9ER65 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms